As duas culturas da dinâmica molecular: quando a física se cruza com biologia no microscópio in silico

A dinâmica molecular simula o movimento dos átomos, prometendo um filme atomístico das moléculas da vida - mas este livro defende que a promessa inicial desta área ultrapassou a sua prática. Os campos de força, os parâmetros empíricos que orientam todas as simulações, são teorias eficazes validadas em sistemas simples, mas aplicadas à biologia complexa. A amostragem, o desafio de explorar conformações relevantes, continua a representar uma lacuna de nove ordens de grandeza entre as escalas temporais acessíveis e a realidade biológica. No entanto, o verdadeiro problema é cultural: a área dividiu-se silenciosamente em dois campos - o rigor baseado na física versus a aplicação biológica - sem conciliar os seus diferentes padrões de evidência. Este livro traça essa história, examina as consequências para o dobramento de proteínas e a descoberta de medicamentos e apela a um regresso à disciplina dos fundadores: tratar cada simulação como uma hipótese falsificável, e não como um espelho da natureza.