Détection et caractérisation de certaines bactéries pathogènes dans l'eau

Les indicateurs bactériens conventionnels restent l'étalon-or pour l'évaluation de la qualité de l'eau. Cependant, la présence de bactéries viables mais non cultivables continue de provoquer de graves épidémies lors de l'utilisation d'eau contaminée par des agents pathogènes à des fins de boisson et/ou de loisirs. L'objectif de ce travail était de combiner la méthode de culture avec la PCR monoplex et multiplex afin de déterminer le risque potentiel de l'eau examinée. Les méthodes de culture ont été utilisées pour détecter des indicateurs bactériens et des bactéries pathogènes sélectionnées, à savoir Escherichia coli O157:H7, Legionella spp. et Helicobacter pylori. En outre, la PCR a été utilisée pour détecter E. coli O157:H7 et une PCR multiplex a été utilisée pour détecter simultanément les six gènes de virulence sélectionnés (flic, stx1, stx2, eae, rfbE et hly). Cent soixante-quinze échantillons d'eau différents ont été prélevés en Égypte. Les échantillons d'eau provenaient du fleuve Nil (branche Rossita), de la mer Méditerranée, de l'évacuation des eaux, des eaux usées des hôpitaux et des eaux souterraines. Legionella spp. et H. pylori ont été détectés par des méthodes de culture sur des milieux sélectifs dans 25 et 33 % des échantillons d'eau examinés, respectivement.