Die Epigenetik im Zentrum der Krebsforschung: Virtuelles Screening und molekulares Docking selektiver Krebsinhibitoren

Krebs ist eine unkontrollierte Vermehrung abnormaler Zellen und gehört zu den Erkrankungen, die mit einer Fehlregulation der Histon-Deacetylasen (HDACs) in Zusammenhang stehen.Wir haben uns auf die Krebsbehandlung durch Hemmung der Histon-Deacetylasen konzentriert, und zwar im Rahmen einer Forschungsarbeit zur Entwicklung neuer Inhibitoren des Enzyms Histon-Deacetylase 8 (HDAC8), das als biologisches Zielmolekül ausgewählt wurde. Unter Verwendung von Methoden des virtuellen Screenings und des Docking mit MVD6.0 haben wir die PDB-Struktur "5FCW" sowie ähnliche Strukturen von PCI34051 und NCC14 herangezogen, die als Referenzinhibitoren ausgewählt wurden. Die Ergebnisse des Docking-Vorgangs mit MVD ergaben einen RMSD-Wert von 0,788 Å, und nach dem Screening wählten wir 20 Posen aus, die die besten Wechselwirkungen mit den für die Wirkung notwendigen Aminosäuren des aktiven Zentrums aufweisen. Um die Anzahl der resultierenden Moleküle zu reduzieren, wurde ein Filter nach der Lipinski-Regel angewendet; nach Überprüfung erhielten wir fünf originäre Moleküle (137633786, 50898670, 59727889, 142365753, 145926745), die Wasserstoffbrückenbindungen mit mindestens einem der drei Aminosäurereste des Aktionszentrums bilden und für die zukünftige Forschung von Interesse sind.