Este trabalho teve como objetivo caracterizar a diversidade genética e estabelecer as relações filogenéticas entre as subpopulações de cobaias da zona agroecológica com pluviometria bimodal dos Camarões. Para tal, foi extraído ADN genómico de 110 amostras de sangue de cobaias selecionadas com base na variabilidade fenotípica, na disponibilidade dos criadores e na acessibilidade aos criadouros. O estudo foi realizado utilizando 16 marcadores microssatélites SSR. Os principais resultados revelam um total de 11 alelos na população. Cerca de 3% da diversidade genética é atribuível à variação entre as populações e o restante deve-se às diferenças entre indivíduos dentro da mesma população. A taxa de homozigotos é elevada nesta população e o coeficiente de consanguinidade é positivo. O conteúdo médio de informação polimórfica e o fluxo genético muito elevado podem prenunciar uma perda de diversidade genética que conduziria a uma redução das oportunidades futuras de melhoramento genético da cobaias. A estrutura da população, bem como a árvore filogenética, permitiram evidenciar a existência de três populações genéticas distintas.
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