Empreintes génétiques d'isolats bactériens résistants à l'arsénite: Empreinte génétique par PCR

L'élimination des métaux lourds toxiques tels que l'arsenic présentait un risque élevé pour l'environnement. L'arsénite [As(III)], une forme réduite de l'arsenic, est plus toxique et plus mobile que l'arséniate [As(V)]. L'objectif de ce travail était d'isoler des bactéries tolérantes à l'arsenic à partir de sols contaminés prélevés dans diverses décharges industrielles du Gujarat, en Inde. Cette étude explore le potentiel de l'analyse par restriction de l'ADN ribosomique amplifié (ARDRA) pour l'identification intra- et inter-espèces de Bacillus sp. Un ensemble d'amorces a été utilisé pour amplifier une partie de l'ADN ribosomique 16S ainsi que l'espaceur 16S à partir d'isolats appartenant à différentes espèces de Bacillus. L'analyse par restriction a été réalisée à l'aide de neuf enzymes de restriction différentes, à savoir Alu I, Hae III, Hpa II, Sau 3AI, Taq I, RsaI, Cac8I, Bst NI et Bsa JI. Les séquences homologues obtenues par la recherche BLAST nucléotide-nucléotide standard (BLASTn) ont été alignées avec la séquence de l'isolat à l'aide du programme CLUSTAL. L'arbre phylogénétique a montré que les isolats appartiennent à un groupe évolutif comprenant des membres du groupe des Bacillus. Cette méthode PCR-RFLP constitue un outil rapide pour l'identification d'isolats bactériens résistants à l'arsénite et la détection de nouveaux taxons.