Genomika porównawcza i strategie projektowania leków

Malaria stanowi zagro¿enie dla ludzko¿ci i jest przyczyn¿ milionów przypadków zachorowä i zgonów na cäym ¿wiecie. Za wywo¿ywanie choroby odpowiada paso¿yt Plasmodium. Niniejsza praca bada i ujawnia ukryte informacje zawarte w genomach paso¿ytów przy u¿yciu analizy porównawczej genomów i badania tendencji w u¿yciu kodonów. Sprawdzono mo¿liwo¿¿ wykorzystania zmiennych biäek powierzchniowych jako wspólnego celu dla leków zarówno w przypadku gatunków Plasmodium zakäaj¿cych ludzi, jak i stwierdzono, ¿e zmienne biäka powierzchniowe nie mog¿ by¿ wykorzystywane jako wspólny cel dla leków ze wzgl¿du na istnienie ró¿nic sekwencyjnych i strukturalnych zarówno na poziomie genomu, jak i proteomu. W niniejszej pracy wykorzystano równie¿ informacje dotycz¿ce sieci metabolicznej w celu identyfikacji nowych celów terapeutycznych. W celu znalezienia prototypów leków wykorzystano równie¿ inne podej¿cia in silico, tj. modelowanie molekularne, generowanie trójwymiarowych modeli farmakoforów opartych na strukturze, wirtualn¿ selekcj¿ i dokowanie itp.