Modelação por homologia das proteínas Cry específicas para dípteros do Bt: Caracterização físico-química e funcional, previsão da estrutura secundária, construção validação de modelos

Foi realizada a caracterização físico-química de 4 proteínas Cry, tendo-se interpretado propriedades como o peso molecular, o pI, o EC, o AI, o GRAVY, a composição de aminoácidos e o índice de instabilidade. Os valores mais elevados de GRAVY e AI foram observados na Cry4Aa (0,827) e na cry2Aa 1 (84,53). Para a caracterização funcional, foram realizadas previsões de motivos, padrões, pontes dissulfureto e estrutura secundária, bem como de regiões transmembranares e domínios das proteínas Cry. Foram utilizadas quatro sequências-modelo (1I5P, ADL6, 2C9K e 1W99) para a modelação por homologia (SwissModel e EsyPred3D) com vista a prever a estrutura 3D. A pontuação LG para as sequências-modelo 1I5P, ADL6, 2C9K e 1W99, apresentada no SwissModel e no EsyPred, indicou que se tratava de um modelo extremamente bom. Os sítios ativos da proteína foram determinados pelo servidor CASTp e variaram entre 83 e 239. A área e o volume da cavidade variaram entre 422,9 e 5828 e entre 518,1 e 3719,2, respetivamente. A validação dos modelos estruturais foi realizada utilizando o PROCHECK. Os modelos foram posteriormente verificados com o WHAT IF. Ambas as estruturas foram analisadas utilizando a ferramenta ProFunc, que revelou que possuíam funções diferentes, uma vez que apresentavam estruturas e sítios ativos distintos. Assim, a estrutura desempenha um papel vital na determinação da sua função.