Montaż i finalizacja genomów prokariotycznych z mapowaniem optycznym

Ci¿g¿e ulepszanie platform sekwencjonowania DNA skraca czas potrzebny na odczytanie i identyfikacj¿ genomów przy coraz ni¿szych kosztach. Jednak sekwenatory nadal maj¿ pewne ograniczenia, takie jak rozmiar fragmentów DNA, które s¿ w stanie zidentyfikowä. W zwi¿zku z tym DNA jest fragmentowane przed sekwencjonowaniem, a po tym etapie ponownie porz¿dkowane tak, aby mog¿o reprezentowä oryginalny genom. Proces ten, znany jako montä genomów, wymaga zastosowania ró¿nych strategii in vitro i in silico. W ostatnich latach zaproponowano ró¿ne strategie montäu genomów, jednak nadal nie ma zgody co do najlepszego podej¿cia. Ostatnio wiele genomów zostäo uko¿czonych przy u¿yciu techniki znanej jako optyczne mapowanie cäego genomu (WGM). Technika ta pozwala na montä wysokiej jako¿ci na podstawie bardzo dok¿adnej mapy restrykcyjnej. Mapa restrykcyjna umo¿liwia orientacj¿ i uporz¿dkowanie kontigów bez konieczno¿ci stosowania genomu referencyjnego. Mapowanie optyczne pozwoli na nadej¿cie nowej ery szybszego, täszego i coraz dok¿adniejszego montäu genomów.

Pagina's: 60, Paperback, Wydawnictwo Nasza Wiedza