Rumo a uma ferramenta de modelação biológica que recomende sub-redes adequadas: Geração recomendações para ampliar redes reações bioquímicas durante

A modelagem é uma tarefa essencial na biologia de sistemas para descrever sistemas biológicos complexos e prever o seu comportamento. Este livro centra-se em modelos computacionais que representam redes de reações bioquímicas. Uma vez que as redes de reações de maior dimensão são frequentemente construídas a partir de redes já existentes de modelos acessíveis ao público, são necessárias ferramentas que permitam localizar e reutilizar facilmente partes de modelos relacionados para integração num modelo em desenvolvimento. Embora existam ferramentas para apoiar o utilizador na pesquisa, fusão ou combinação de modelos, ainda é necessário um elevado grau de esforço manual para realizar tarefas de reutilização. Além disso, a quantidade e a complexidade dos modelos publicados tornam praticamente inviável a pesquisa manual de redes adequadas. O objetivo da investigação descrita neste livro é desenvolver métodos que sugiram aos utilizadores sub-redes adequadas para integração durante a modelação. Os resultados obtidos constituem uma base sólida para o desenvolvimento de um sistema de recomendação que forneça aos modeladores recomendações sobre como alargar o seu modelo. Esse sistema de recomendação facilita a reutilização eficiente de redes e diminui o esforço manual para encontrar e integrar estruturas relevantes.