Determinazione computazionale di nuovi biomarcatori del cancro al colon: Geni driver specifici per stadio e sottoreti

Questo lavoro rappresenta un nuovo approccio di biologia dei sistemi volto a decifrare l'identità di geni specifici e dei loro prodotti coinvolti nella progressione del cancro del colon, dalla tumorigenesi fino alla metastasi. È stata condotta una meta-analisi basata sugli stadi clinici dei dati di sequenziamento del genoma tumorale disponibili nel dominio pubblico e sono stati impiegati diversi approcci per individuare nuovi geni che guidano l'insorgenza, la progressione e la metastasi del cancro del colon. I geni driver specifici per stadio individuati per consenso hanno portato alla costruzione di reti ad hoc specifiche per stadio, che sono state analizzate per la centralità dei geni, il raggruppamento delle sottoreti e l'arricchimento dei processi di ontologia genica. Sono stati identificati nove nuovi geni driver come centrali per l'insorgenza e la tumorigenesi del cancro del colon. Tre, quattro e tre nuovi geni driver sono stati identificati come hub per la progressione rispettivamente allo stadio II, allo stadio III e allo stadio IV. I nostri risultati sono stati supportati da moduli di sottoreti e dall'analisi ontologica. Il nostro studio ha individuato potenziali biomarcatori diagnostici per il cancro del colon, nonché nuovi bersagli farmacologici specifici per stadio per un intervento razionale. La nostra metodologia è estendibile all'analisi di altri tipi di cancro per colmare le lacune nelle nostre conoscenze.

Pagina's: 52, Paperback, Edizioni Sapienza