Il farmaco antitumorale doxorubicina si lega al DNA e all'RNA in punti diversi

Negli ultimi 50 anni, la doxorubicina (DOX), nota anche come adriamicina, è rimasta uno dei farmaci chemioterapici antitumorali più efficaci per il trattamento di diversi tipi di tumori. Confrontiamo i siti di legame della doxorubicina con il DNA e il tRNA. Il legame della DOX avviene tramite intercalazione nel duplex del DNA, mentre si lega al tRNA attraverso il solco maggiore e quello minore. L'intercalazione DOX-DNA avviene in prossimità di A-7, C-5, *C-19 (legame idrogeno con il gruppo NH¿ della DOX), G-6, T-8 e T-18, con un'energia di legame libera pari a -4,99 kcal/mol. I legami DOX-tRNA si verificano in prossimità di A-29, A-31, A-38, C-25, C-27, C-28, *G-30 (legame idrogeno) e U-41, con un'energia di legame libera pari a -4,44 kcal/mol. L'intercalazione del farmaco ha indotto una transizione parziale da B ad A nel DNA, mentre il tRNA è rimasto nella struttura della famiglia A. Le differenze strutturali osservate tra i legami del DOX al DNA e al tRNA possono costituire le ragioni principali dell'attività antitumorale del farmaco. I risultati del test MTT in vitro sul carcinoma del colon SKC01 sono coerenti con i cambiamenti strutturali del DNA osservati.