L'EPIGENETICA AL CENTRO DEL CANCRO: Screening virtuale e docking molecolare di inibitori selettivi antitumorali

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Bol Il cancro è una proliferazione incontrollata di cellule anomale ed è una delle patologie correlate alla deregolazione degli enzimi deacetilasi degli istoni (HDAC).Ci siamo concentrate sul trattamento del cancro basato sull'inibizione delle deacetilasi degli istoni, nell'ambito di una ricerca volta allo sviluppo di nuovi inibitori dell'enzima deacetilasi degli istoni 8 (HDAC8), che è stato selezionato come bersaglio biologico. Avvalendoci dei metodi di screening virtuale e di docking con MVD6.0, abbiamo utilizzato il PDB '5FCW' e i suoi omologhi PCI34051 e NCC14, scelti come inibitori di riferimento. I risultati del docking con MVD hanno fornito un valore di RMSD = 0,788 Å e, dopo lo screening, abbiamo selezionato 20 pose che rappresentano le migliori interazioni con gli amminoacidi del sito attivo necessari per l'azione. Per ridurre il numero delle molecole risultanti, abbiamo applicato un filtro in base alla regola di Lipinski e, dopo la verifica, abbiamo ottenuto cinque molecole originali (137633786, 50898670, 59727889, 142365753, 145926745) che formano legami idrogeno con almeno uno dei tre residui del sito attivo, il che le rende interessanti per future ricerche.

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Il cancro è una proliferazione incontrollata di cellule anomale ed è una delle patologie correlate alla deregolazione degli enzimi deacetilasi degli istoni (HDAC).Ci siamo concentrate sul trattamento del cancro basato sull'inibizione delle deacetilasi degli istoni, nell'ambito di una ricerca volta allo sviluppo di nuovi inibitori dell'enzima deacetilasi degli istoni 8 (HDAC8), che è stato selezionato come bersaglio biologico. Avvalendoci dei metodi di screening virtuale e di docking con MVD6.0, abbiamo utilizzato il PDB '5FCW' e i suoi omologhi PCI34051 e NCC14, scelti come inibitori di riferimento. I risultati del docking con MVD hanno fornito un valore di RMSD = 0,788 Å e, dopo lo screening, abbiamo selezionato 20 pose che rappresentano le migliori interazioni con gli amminoacidi del sito attivo necessari per l'azione. Per ridurre il numero delle molecole risultanti, abbiamo applicato un filtro in base alla regola di Lipinski e, dopo la verifica, abbiamo ottenuto cinque molecole originali (137633786, 50898670, 59727889, 142365753, 145926745) che formano legami idrogeno con almeno uno dei tre residui del sito attivo, il che le rende interessanti per future ricerche.


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Merk Edizioni Sapienza
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  • 9786630672626
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