La bioconversión de biomasa lignocelulósica en azúcares monoméricos, mediante la acción de enzimas celulasas, es la etapa más lenta y costosa del proceso de obtención de biocombustibles de 2da generación, y se convierte en la principal dificultad económica que obstaculiza el aprovechamiento rentable de esta abundante fuente de energía. Un posible camino en la optimización de la etapa de sacarificación para la producción de bioetanol, es profundizar los conocimientos sobre las características moleculares de los sistemas enzimáticos secretores de celulasas fúngicas, mediante el empleo de diferentes estrategias biotecnológicas como sobreexpresión del gen, clonado, transformación, entre otros. Estos parámetros deben ser analizados desde el punto de vista genómico y proteómico, con el fin de aportar información clave para el mejoramiento de los procesos biotecnológicos. En los últimos años, debido al gran avance de las técnicas moleculares, se han desarrollado metodologías rápidas, precisas, objetivas y aplicables a un gran número de muestras para la detección y caracterización de diversos genes fúngicos, basadas en el análisis de ADN por la reacción en cadena de la polimerasa (PCR).
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